故事发生在孟买圣雄甘地国家公园之中，一群动物在森林里快乐的生活着，直到有一天，人类的伐木机驶向了这片动物们赖以生存的家园。小豹尤为（塔拉·斯特朗 Tara Strong配音）的父亲死于猎人的枪下，悲痛之中，尤为召集了森林里的动物们，为它们的未来出谋划策。 小猴巴酱（范妮莎·L·威廉姆斯 Vanessa Williams 配音）提议正式和人类开战，大熊巴嘎（布拉德·加内特 Brad Garrett配音）不同意巴酱的看法，它希望能够找到一条和平解决问题的道路。商讨之下，一干动物决定去德里国家会议抗议示威，之后却发现它们没有人会说人类的语言，除了淡泊名利只想安静生活的鹦鹉艾利克斯（汤姆·肯尼 Tom Kenny 配音）。
U. C.0097时期，“拉普拉斯事变”的纷争终结后，2架独角兽高达被秘密封印，新吉翁残党“袖章”也随之瓦解。就在人类逐渐走出战争带来的阴影之时，失踪两年的独角兽三号机“凤凰”突然现身，拥有颠覆世界秩序力量的它即刻引发了地球联邦军、吉翁袖章残党以及路欧商会三方势力的争夺狩猎，一场宇宙对决也即将拉开帷幕......
谁说猫鼠不能做朋友？谁说损友不能一起拯救世界？在一个多种动物组成的现代化世界里，动物特工局精英张大威（猫）在因缘际会下结识废柴技术宅阿丘（鼠），当傲娇成性、嘴硬心软的张大威遇见幽默呆萌、重情重义的阿丘，会发生什么欢乐逗趣的故事？这对被卷入一场惊天阴谋的猫鼠搭档，在破案的途中联合其他伙伴各显神通，斗智斗勇。随着一个名叫“寒冰魔鬼”的幕后黑手的出现，令人不寒而栗的真相渐渐浮出水面……
