本片讲述的是蝙蝠侠（罗杰·克雷格·史密斯 配音）以及罗宾联合正义联盟成员闪电侠以及绿箭侠一起对抗被称为Animilitia的犯罪组织。该犯罪组织都是由一些动物性的成员组成，包括银背大猩猩、猎豹女、杀手鳄鱼等，他们在高谭市作恶多端，一般警察对他们束手无策。而且该组织背后的主谋却指向蝙蝠侠的宿敌，同时也是高谭市叱吒风云的黑道大亨企鹅人（Dana Snyder 配音）。除了Animilitia组织，蝙蝠侠他们这次还要面对奥斯瓦德公司的商人新发明的邪恶网络动物机器人，一群犯罪恶势力再次聚集在高谭市。
将会在全国大赛上出场的，是我们北宇治高校吹奏乐部。 告别酷暑，凉意渐浓，金秋的脚步越来越近。 “前辈可能会退部...” 突如其来消息的袭向我们，笼罩在大家心头的是无法轻易消去的不安。 长得迷人而又善于领导，高超的上低音号奏者，那位深受大家信赖的“特别”的前辈。 只是，那如冰山一样不流露分毫的表情，那拒人于千里之外的瞳孔，分明又是位拒绝让任何人看透自己的前辈。 "想要参加全国大赛"，明明比谁都更想去，明明只是高中生，却硬是要装作大人的前辈。 这样的前辈，明明是我不擅长对付的... 非要说的话，我也许不那么喜欢她 这样的我, 为什么会——
一艘海军潜艇在马里亚纳海沟神秘沉没，正义联盟派出钢骨维克多（Shemar Moore 配音）调查，谁知维克多却在事故现场遭到一伙神秘对手的袭击。在此之后，超人（Jerry O'Connell 配音）、黛安娜（Rosario Dawson 配音）、闪电侠（Christopher Gorham 配音）、绿灯侠（Nathan Fillion 配音）、蝙蝠侠（Jason O'Mara 配音）、神奇上尉等正义联盟伙伴相继云集总部，经联合调查后发现幕后真凶竟与古老的亚特兰蒂斯有关。这群深海战士在野心勃勃的奥姆王子的率领下向人类宣战，两个种族的全面战争一触即发。危机时刻，不久前刚刚承受丧父之痛的男子亚瑟（Matt Lanter 配音）成为事件的关键。 以此为契机，亚瑟以及整个正义联盟的命运都发生了改变…
阿加莎是个古怪的小女孩，总是发明一些奇怪的监视设备，并自诩为侦探。跟随妈妈搬入新社区后，她接到了一单调查商店失窃的案件。很快阿 加莎锁定了嫌疑人：住在隔壁的文森特。她偷偷翻进文森特家里探查，不料被文森特发现。妈妈以刚搬进街区促进交流的借口让文森特教她轮滑。文森特每次下午便失踪一阵子，阿加莎经过跟踪、打听等手段，得知文森特曾经有个好朋友，她认为文森特在废弃的工厂绑架了那个小女孩。阿加莎想要劝服文森特，深感被误会的文森特在众人的指责下离家出走。妈妈认为阿加莎在说谎，关停了她的侦探所。仍沉迷在侦探身份的阿加莎看到文森特偷偷回家，悄悄尾随他，发现他进入商店偷了一些狗粮。文森特气愤的跑开，而手抱狗粮的阿加莎被误认为是商店小偷。阿加莎明白了一切，原来那个好朋友“小女孩”只是文森特的狗，他的哥哥对动物过敏，只好将狗狗送人，但文森特舍不得，又将其要了回来放到工厂里，偷那些狗粮也是不得已。生病的狗狗咬了文森特一口，阿加莎来到工厂，看到发烧的文森特，她急忙叫了救援，救了文森特和狗狗。文森特最终好了起来，将小狗送给喜欢狗狗的阿加莎，而阿加莎小侦探的名声也传播开来。
