堂本一辉是著名的钢琴演奏家，两年前突然宣布不再演奏钢琴转而攻向管风琴，更斥资建造了堂本音乐厅，准备在落成之日举行演奏会。然而在演奏会之前，堂本音乐学院的学生相继死去，先是爆炸案，后是单个被杀。 园子带着柯南一行人来听排练，认识了女高音歌唱家秋庭怜子，拥有绝对音感的秋庭也开始遭遇到危险：润生茶被下药、作森林浴时遭遇空气枪袭击、试演会当天更遭击晕。 然而就是从这些事件中，柯南找到了推理的逻辑：凶手试图把秋庭排除在凶杀外。这边已经正式开演的演奏会浑然不知音乐大厅外已是爆炸连天，小兰、灰原哀以及演奏厅内的一千多人顿时危在旦夕，绝对音感成为了唯一的救命线索。柯南找到了爆炸的逻辑，要在罪犯引爆最后一个炸弹前，把他找出来。
泰德（凯瑞·莎勒KerryShale配音）是一名芝加哥的普通建筑工人，但却从小怀揣着成为一名考古学家的梦想，因此常常在工作中神游万里而被频频解雇。就在第七次被解雇之后，泰德去看望他的考古学朋友亨伯特教授，然而此时教授刚刚受邀去印加古城探索一个重要发现，却恰巧因生病不能前往。阴差阳错之下，泰德被当成亨伯特教授远赴秘鲁，与年轻火辣的考古学工作者萨拉（菲奥娜·格拉斯科特FionaGlascott配音）一道，在壮美神秘的热带沙漠和丛林里，携手寻找传说中的印加黄金城。一路上和秘鲁导游弗雷迪、小土狗杰夫、鹦鹉贝尔佐尼甚至一只守卫黄金城的神秘木乃伊一起，开启了一段离奇刺激的探险之旅……该片主角泰德的人物形象主要基于《夺宝奇兵》印第安纳·琼斯的故事。
