由于父母离异，刚满10岁的忠志（神木隆之介饰）只好跟母亲来到乡下跟外公一起生活。一次偶然，忠志参拜神社时被选为“麒麟送子”。当地有个传说，被选为麒麟送子的孩子可在大天狗山顶，拿到传说中大天狗守护的飞剑。传说那飞剑是用来维护和平的，伙伴们揶揄他不敢上大天狗山取麒麟送子的宝剑。他在尝试一半后，被吓回来。 另一方面，千年魔人加藤保宪（丰川悦司饰）复活，他利用废旧物品的怨气，将其与抓来的妖怪们扔到大怨灵炼火中融合形成邪恶的怪物军团，并率领它们企图毁灭人类。在山神、河童和川姬等妖怪的努力下，忠志通过了考验。为了保卫世界，忠志决定和妖怪们齐心合力，和大恶人决一死战，妖怪大战争正式展开！
上古世界，人妖共存，三界之中开有一间医馆，只医妖不救人。传闻医馆两人一兽，掌柜医师红娘风情万种，助手叁池娘炮一枚，杂役多肉（蛤蟆精）人面妖身。原本风平浪静的妖医馆，却因为一位不速之客书生金志坚的到来，陷入危机。书生怀孕，本是奇闻，奈何妖种竟是稀世魔丸。红娘本欲为其接生，取魔丸心头血方能破解自身命格缺陷，不想经过几日对魔丸的悉心照料，一人一兽产生情谊。红娘决意放走魔丸，却遭遇悬甲门围堵。原来一切都是掌门雄魁的计谋，他要用魔丸心头血培养嗜血菱花，以吸食妖族血脉为自身延寿，至此，红娘陷入绝境……
影片讲述对数字不敏感的大学生李玄武，在考试失利后参加高数补习班从而引发的一连串故事。
