故事主要讲述了几世前一位默默无名的小药童，不愿与无良药商同流合污，用生命守护药草，最终药草吸附了药童的鲜血有了灵性。几世轮回，以钩藤为首的四味药草（钩藤、曼罗、水苏、豆蔻）幻化为药灵，有了人的模样，他们必须再次寻找到一位真心驭药人，用鲜血滋养药身，才能真正修炼成仙。而一旦他们成仙，世间也便再无这味药草。云来镇小药师林东笙，心怀济世之梦，努力寻找这四味绝迹药草治病救人。在双方互相寻找的过程中，曼罗等终于发现林东笙即前世用命守护自己的种药小子，想要报恩时，却被与林家世代结仇的刘虎设下诡计，陷害林东笙蓄意下毒，引来官府及药灵谷的双重追杀。曼罗为保护林东笙不惜与钩藤、水苏等决裂，在拯救苍生与自我获益之间，每个人都面临着重要抉择……
这是一部关于探索人的内心世界的影片，这部影片中没有一句人物台词，纯视听语言讲述故事的探索性电影，片中的主人公叫公保东珠，过着游牧生活，有两个爱财如命的盗墓贼在公保东珠家的坟地上发现了宝物，为了获得宝物，他俩不择手段地蒙骗公保东珠，且破坏当地生态坏境，公保东珠想尽办法坚守坟地上的宝物和圣山河流，后来两个盗墓贼在坟地附近炸矿的时候，没弄好炸药，结果两人都被炸死了，另外，死亡是人类永恒的主题，影片通过主人公的妻子过世，他开始思考生与死的问题，并在现实生活中寻找如何发现死亡的本质到接受死亡，最后生与死的圆满融合的智慧。
书生王贤第一次赶考时，被吏部的吴侍郎索要3000两“孝敬银”，王贤因家贫交不起而被抹去功名。三年后再考，途中被贼人所劫，后被当做凶手抓进牢房，最终顺利得中头名状元，被委任阳翟县令。王贤断案中牵扯出三年前的那桩血案，原来他三年前埋葬的女尸，就是遇害者胡媚娘。他之所以再考能够顺利，是胡媚娘的暗中相助。王贤答应彻查此案，然而幕后的凶手收起了狰狞邪恶的面目，接近王贤，并给他安排了温柔陷阱。蓉蓉的出现，使王贤渐渐迷失自我。他该如何决断，才能使沉冤昭雪？胡媚娘面对王贤的变化，为使真凶不逍遥法外，她又该怎么做？本片所述案情看似松散，却紧紧相连，扑朔迷离，荒诞不经中却反映了人性。少许的神话色彩，场景的恐怖阴暗，颇有老版《聊斋》的气韵，给人一种似曾相识的怀旧感。
