首都消失

　　未来某年的7月2日，美国各地的监视站发现一艘直径达数百英里的巨大飞船接近了地球。飞船发出的无线电信号干扰了地球的通信卫星信号，并放出了多艘直径达15英里的子飞船飞抵地球上各大城市的上空。外星飞船敌友未明，人们陷入了恐慌和迷惑。
　　电脑工程师戴维（杰夫•戈德布拉姆 饰）破译出外星人发出的无线电信号，其实是攻击的倒计时信号，他设法通知了前妻，总统的助理康妮，但是为时已晚，7月3日，外星人的飞船开始攻击地球，人类文明瞬间遭到巨大的打击和灾难。总统（比尔•普尔曼 饰）等人撤离到军事基地，指挥空军反击，却犹如以卵击石，毫无作用，军事基地也被摧毁，唯有飞行员史蒂文（威尔•史密斯 饰）设法诱使一架外星人战斗飞艇坠毁。
　　幸存者们逃到了秘密军事基地，在那里，科学家们一直在研究一艘50多年前坠毁的外星飞艇，致力于找出对付外星人的办法，那里也是人类最后的希望……

　　19世纪的中国，博士、Yaz和Dan误打误撞来到广东沿海一个小渔村，在遇上著名女海盗郑一嫂后，深藏在深海恐怖的海魔阴谋慢慢浮现，博士能联合郑一嫂与同伴们阻止海魔释放恐怖的力量吗？

2009年，当麻纱绫（户田惠梨香 饰）和濑文焚流（加濑亮 饰）相识的前一年。在美国FBI学成归来的当麻被分在警视厅公安部公安第五课未详事件特别对策系，接受组长野野村光太郎的直接领导。此前不久，某大型石油企业高管接连被人杀害，死者的心脏无一例外都留下被人用手捏过的痕迹。显而易见，这一系列事件和所谓的SPEC持有者有着极为密切的联系。与此同时，石油企业高管Diablo（大杉涟 饰）高薪聘请神秘SPEC持有者一十一（神木隆之介 饰），企图阻挡神秘的SPEC杀手。一十一，这个日后与当麻和濑文有着不解渊源的难缠敌手将当麻视作杀害父母的爆弹女，之后更斩杀了当麻在美国结识的好友Nancy。
　　SPEC宏大篇章自此拉开序幕，决定世界命运的重大事件也进入了倒计时…

　　迈可透过一张光碟，参加了一场刺激的游戏，在月黑风高的晚上他发现自已稍稍走进一间屋子并从厨房拿刀子杀死一个沈睡著的男人当迈可醒来时他兴奋极了，这一生他从没有这么刺激和开心过，第二天当他看到新闻。天啊！那件谋杀案真的发生了吗？后来第二张CD又寄来了，他决定结束这场荒谬的游戏，但主谋者从迈可的电脑中走出来，他竟是一具有形象的＂人＂，并且一再要胁迈可再玩下去，也挑唆他面对恐惧和幻象，迈可就像受催眠一般他无处可逃，主谋者已经完全控制了他使他分不清什么是真什么是假……

　　地球就是个人鼠星球，在AB某年