小熊猫源克历尽千辛万苦终于找到了失散多年的父亲，开始了学习中医的历程。但黑虎与马戏团团长申野合谋了组建大型马戏团的计划，于是开始抓森里里的动物。就在这时黑虎突然病倒，并且很严重。小熊猫源克最后用针灸终于治好了黑虎的病。黑虎开始反思自己并且悔过自新，释放了森林里的所有动物。
电影在法国开始，反派和空中都市的王子（诹访部顺一配音）带着婴儿在一架飞艇上，空贼潜入飞艇把婴儿劫走，鲁邦三世半路杀出夺宝。 少女空贼尤缇卡（石川由依配音）阻拦不成反被袭胸，恼羞成怒之际扇了鲁邦一耳光，鲁邦从飞艇上掉进了塞纳河...... 鲁邦带着婴儿和一块记载了空族宝藏所在地的水晶跑回了据点，发现包里装着一个婴儿后，鲁邦与次元大介两个大男人的噩梦到了。毕竟偷盗是工作，鲁邦与次元两人带着婴儿又干了好几票盗窃案。直到钱形幸一警部跟着鲁邦的脚步来到了罗马。 因为与鲁邦有关，反派和王子就叫来钱形去夺回婴儿。另一方面，反派的秘书竟是峰不二子。 在一次盗窃中，鲁邦与次元被老叔追得逃进了古罗马斗兽场。尤缇卡乘机夺回婴儿逃回基地，不曾想鲁邦尾随而至，更意外的是空贼内部出了叛徒，最后族长（菅生隆之配音）把基地炸掉同归于尽，鲁邦次元带着婴儿与女主逃掉了......
故事讲述的是身怀神秘力量的少女Doris和同伴一起来到魔术学院，学习魔法来拯救被黑魔法诅咒的叔叔和婶婶。
