故事承接第一部结尾，自从森林王子莫格利（海利·乔·奥斯蒙 Haley Joel Osment配音）认识了人类女孩珊迪（梅·惠特曼 Mae Whitman配音），便随她一同居住在人类村庄中。然而离开丛林生活的莫格利，却在新的环境里异常想念他的动物朋友们，尤其是待他非常好的黑熊巴洛（约翰·古德曼 John Goodman配音）。来自远方森林的召唤，让莫格利决定重新回到森林的怀抱中去。然而从前自由自在的森林生活，此刻却变得危机重重。老冤家老虎希瑞·坎（托尼·杰伊 Tony Jay配音）正在酝酿一场复仇计划。 由迪斯尼公司卡通片导演斯蒂夫·特伦伯斯执导的卡通片《森林王子2》，依旧保持着迪斯尼卡通片一贯轻松诙谐的风格笔调。著名童星海利·乔·奥斯蒙特是第四次为迪斯尼的卡通片配音，而倍受好评的配音演员约翰·古德曼此次更是倾情献声。流畅的故事情节，鲜活的人物角色，以及精美的配乐音效，《森林王子2》再次为您打造一场充满着纯真和关爱的丛林冒险故事。
动画分为三个短篇。《一碗乡愁》：青年小明（坂泰斗配音）独自一人离开故乡来到大城市北京打拼，掐指一算，他已经很久没有回去过了。某日，小明拖着疲惫的身躯去往上班的路上，忽然怀念起了家乡的味道。往事伴随着思念渐渐浮现。
在广阔的沙漠之中有一座神秘的梦幻城，小伍、雪儿和小米从小就生活在梦幻城，三个小伙伴的梦想就是进入梦幻森林，愿望即将成真，梦幻森林隐藏着什么秘密？三个小伙伴将开启一段不为人知的梦幻冒险之旅。
就读国中的女孩有栖川彻子（苍井优 配音），因父母离婚而转学来到了石之森学园。令她有些气闷的是，同学们皆以诡异的目光看她，甚至对她敬而远之。从同班同学睦美口中得知，彻子现在所坐的桌子，其前主人曾经陷入一起被称为“犹大及其四位妻子的杀人事件”。而那张桌子后面还有一张桌子，其主人荒井花（铃木杏 配音）长期旷课，花也恰恰是彻子现在的邻居。为了弄清杀人事件的真相，给自己起名“爱丽丝”的彻子壮着胆子进入花的家，进而得知了关于“犹大”的种种往事。 以此为契机，这两个性格有些古怪却灵巧可爱的女孩开始了她们伟大的友谊……
19世纪，大不列颠帝国雄霸海上，维多利亚女王骄扬跋扈（伊梅尔达·斯汤顿 Imelda Staunton 配音），但是横行四海的海盗仍令她愤恨不已。这群不法之徒中，海盗船长（休·格兰特 Hugh Grant 配音）则显得有些寒酸，他手下跟着一帮老弱病残，每次打劫虽然斗志昂扬，却总是了无所得。这一天，他在血色之岛上受到了业内高手黑鬼贝拉（杰里米·皮文 Jeremy Piven 配音）和弯刀莉兹（萨尔玛·海耶克 Salma Hayek 配音）等人的嘲笑。为了证明实力，赢得年度海盗大奖，船长开始四处劫掠，结果意外结识了生物学家达尔文（大卫·田纳特 David Tennant 配音）。达尔文发现，船长的宠物竟然是早已灭绝的渡渡鸟。于是他花言巧语劝诱船长去伦敦参加年度科学家大赛，而船长也离他的海盗之路越来越远……本片为英国阿德曼公司首部3D粘土停格动画。
「神秘事件公司」成員一行人決定放下忙碌的偵探工作，來到熱帶島嶼好好度假。沒想到，他們發現這座小島不僅似曾相識，而且還被突然出現的殭屍大軍追得到處跑！這次的謎團真相，究竟只是狡猾罪犯在裝神弄鬼，還是真的有看不見的超自然力量在作祟？
