公元2186年，人类爆发了精神危机，AI乘虚而入创造“完美世界”和心灵孵化区，只有通过心灵值测评才能通向完美世界。Jacky和渡休一起生活在孵化区内，对完美世界充满向往，在一次心灵评测失败后由于抱怨导致两人心灵值被监视官扣至为零，于是他们找到地下组织“沖激钻”打算非法离开孵化区。但渡休的冒险偷渡方式不被Jacky认同，两人争执致使感情决裂。Jacky担心渡休安危，继而向千灵圣女求援，而千灵圣女则是一具被AI操控的雌雄两性躯体，心灵孵化则是她操控人类的手段。Jacky弄巧反拙，令渡休的意识被强制回收，同
2018年，天网系统与人类的战争使世界陷入了末世般的境况，反抗军精神领袖约翰·康纳（克里斯蒂安·贝尔 Christian Bale 饰）带队执行一次任务的过程中获得了战胜天网的新思路，而天网系统适时推出了新的目标排名，康纳位居次席，榜首上康纳此时尚年青的父亲凯尔·瑞斯赫 然在列。与此同时，一名遗忘了自身过去经历的强壮男子马库斯（萨姆·沃辛顿 Sam Worthington 饰）出现在洛杉矶的废墟中，他与反抗军战士瑞斯偶然结识，并组队前往反抗军总部，不料途中遭机械人袭击，瑞斯被俘。落单的马库斯经由反抗军女战士布莱尔引路，迎来了与康纳命中注定的相遇，但人与机械的对立让康纳不得不视对方为敌人…… 瑞斯在天网中心生死未卜，同时反抗军高层不肯推迟强行进攻计划，留给康纳的时间不再充裕，他只能选择进行一场赌上性命与荣誉的潜入行动。
一名老人從他遺世獨立的農場出發，走在塵土飛揚的道路上，前往鄰近的鄉村。陪伴他的是一位沈默的鬼魂，老人在五十年前曾目睹他的死亡。數十年來，老人都對因結核病過世的母親感到遺憾，心理疾病的折磨讓他產生了病態的需求，為了讓自己好過，他開始秘密協助生病的婦女進行安樂死。當他發現身邊的鬼魂伴侶能夠協助他穿越時空，老人立刻計畫回到過去，意圖說服年輕的自己去避免讓母親受到絕症的折磨。然而，他並未意識到自己的行為將對未來產生什麼樣恐怖的影響⋯⋯
地球物理学家田所雄介博士（小林桂树饰）带领自己的团队前往深海科考，却发现海底出现异常龟裂与乱泥流，在一系列调查之后，他得出来日本列岛在一年后即将沉没的结论。可是日本政府的官员们却认为田所博士的预测只不值得相信的谎言。只有山本首相（石坂浩二饰）认识到事态的严重性，并且委任田所的前妻鹰森沙织（大地真央饰）为危机管理大臣，带领田所博士和他们的团队设法拯救日本。很快，从北海道开始，日本诸岛先生发生大规模的地质灾害，整个日本陷入一片恐慌。政府对于灾害束手无措，仅有的海外移居政策完全不能应对急剧恶化的态势，日本诸岛完全沉没的现实即将上演。最终，田中博士和自己的科考队员们终于找到一个可以挽救日本的方法，但这个方法的实际操作却困难重重……此片改编自日本科幻小说家小松左京的同名畅销小说，该片斥资20亿日元，是近年来日本影坛投资最大、宣传最大的灾难片。
