时间来到最终决战的两年后，在本应已迎来和平的地球上，怪兽们再度倾巢而出。 与此同时，世界各地相继发生了各种入侵超古代遗迹的事件。而GUTS-SELECT（精英胜利队）也迎来了新的队长——时冈（中村优一 饰），众人开启了调查。 一场关乎宇宙前途命运的鏖战就此拉开序幕。 挺身而出的G UTS-SELECT、前来驰援的泽塔奥特曼还有身处战斗中心的特利迦奥特曼的面前出现的是……浑身散发着不祥之气的影之继承者——邪恶特利迦的身姿。 为了守护大家的笑容，特利迦奥特曼、GUTS-SELECT的队员们以及夏川遥辉/泽塔奥特曼（平野宏周 饰）、伊格尼斯/黑暗特利迦（细贝圭 饰），将一同投身这场光与影的大决战！
《红色派系：起源》的故事将沿用游戏的背景和人设：自Alec Mason带领火星殖民地重获自由已经过去了25年，而他的妻子被杀，女儿Lyra被绑架也过去了12年，Alec自那时起便已是一名破碎的英雄。他剩下的唯一的儿子，Jake Mason，现在已经成为了红派民兵(Red Faction Militia)的军官，当他发现12年前被绑架的妹妹至今还活着时，他的世界被颠覆了。 即使有新的敌人蜂拥至火星，但Jake依旧决定去寻找他的妹妹，但他发现Lyra现在却成了敌对势力的一员，一个冷血的战士，发誓要毁掉红派(Red Faction)。Kate Vernon将饰演The Matriarch，入侵者的族长。
深太空探测船发现一个潜在的可居住的星球后，派遣了生化人和人类组成的远征队，去调查星球资源，而其实，这是一颗全是异形的星球……
2015年，朋友派出的恶魔推销员遍布世界各大主要城市，致命的病毒就此蔓延，全球愈20亿人丧命。在此之后，朋友开发出的疫苗拯救无数绝望的生灵，他再次被人类奉为神明，朋友帝国的统治进一步加强。 与此同时，以义常（香川照之 饰）为首的“贤知一派”和神奈率领的“冰之女王军”与朋友及其地球防卫军接连展开对抗。在被高墙封闭起来的东京，朋友做出新的预言，“2017年8月20日这天，外星人将来到地球散播更为致命的病毒，全人类都会因此灭亡”。人类危在旦夕，革命军加紧部署，阿区（丰川悦司 饰）、贤知（唐泽寿明 饰）、青蛙仔（宮迫博之 饰）、丸夫（石塚英彦 饰）也相继回到这里。关系人类命运的最终决战即将展开…… 本片根据浦泽直树同名漫画改编，影片简介中涉及的人名均以原著漫画中文版翻译为准。
由于年龄的原因，詹妮弗康纳利教授经常被描述为科学神童。她是我们的时代的天才，拥有 5 个博士学位，包括心理学、精神病学、神经病学、物理学和化学。詹妮弗的主要研究是梦境及其对清醒思维的影响。在过去的 6 年里，她的研究使她提出了一个理论，即有了合适的设备，她不仅可以观察和记录别人的梦境，甚至可能以潜意识的方式影响他们。为了证明这个理论，并相信它可能有军事用途，詹妮弗所在的牛津大学学院获得了一笔可观的政府拨款，用于制造她进入这个新的未知神经科学领域所需的设备。制造完成后，康纳利教授决定在自己身上进行实验，在睡着后，她遇到了一个人工智能“亚当”，这是她发明的意外副产品，也是她进入自己创造的世界的管道。
