改造

　　一名叫达尔的走失男孩被小镇人们发现，由于没人认领，他被带到福利院。经过检查，医生发现他身体各项机能正常，而且智商很高，只是失去了一部分的记忆。
　　达尔被安排暂时居住在安迪家。安迪和妻子乔依斯一直希望能够领养一个孩子，达尔的到来令他们异常兴奋。在相处的过程中，达尔和邻居家的小男孩特塔成为了非常要好的朋友，他们一起上学、一起玩耍、一起为安迪的棒球队赢得了胜利，大家都觉得达尔是个非常聪明而且惹人喜爱的男孩。
　　忽然有一天，两个自称是达尔父母的人来接走了达尔，这令安迪全家和特塔非常伤心。达尔也对他们产生了深厚的感情，恋恋不舍地离开了安迪家。
　　事实上达尔是一个在大脑中被植入芯片的机器人，但他现在具备了一个正常孩子的一切生理机能。来接他的也并非他的父母，而是制造他的博士。博士被达尔和安迪他们的深厚情感所感动，他希望达尔能像正常孩子一样生活，但国家的高级官员却要求摧毁达尔。博士在同事的配合下，将达尔带出试验基地，遭到警察的追击，途中博士为了掩护达尔中弹身亡。
　　达尔潜入空军基地，开着战斗机向安迪家的方向飞去。空军基地地面遥控飞机在飞行过程中自动摧毁，达尔弹出飞机，降落在安迪家旁边的湖中。达尔终于回到了属于他的“家”中。

　　喬瑟夫斯蒂德曼（羅艾爾達德 飾）是一位家庭生活失意、和女兒感情產生裂痕的中年男子，某天他被一位喪心病狂的科學家綁架後強制作為實驗對象，未料實驗結果卻讓他意外擁有了毀滅性的強大超能力。此時，宇宙的伽馬射線爆發為地球帶來致命的巨大威脅，地球上的人類無力守住家園，喬瑟夫決定用他的超能力拯救最摯愛的女兒與全世界，殊不知這個超能力不只能夠拯救地球，也足以摧毀地球……。

　　故事发生在未来世界，阿龙（黎明 饰）和阿强（张学友 饰）都是抓捕妖兽的特警队警员，但是上司（袁和平 饰）非常器重阿龙，而对阿强就戒心重重。阿强气不过在酒吧买醉，得到了女友（李若彤 饰）的支持宽慰。然而，他心头总是笼罩着阴影——原来阿强的母亲也是妖兽，后来他把这个隐秘告诉了阿龙。阿龙也坦白了自己跟妖兽幻姬（李嘉欣 饰）的一段感情……
　　此后，阿龙在一次抓捕元大宗（仲代达矢 饰）的行动中，重逢了现已成为元妻的幻姬，情急之下却要引出重重误会。其实，元大宗是要跟人类合作的妖兽，但是另有一股液态妖兽正在肆虐地侵袭这个城市。在对抗液态妖兽的过程中，阿龙与幻姬的感情经历了生死的考验，但是元大宗的儿子鬼众道（张耀扬 饰）却设计离间意图消灭人类，与此同时阿强也发现了特警队的叛徒……

　　自2002年X档案的六年后，前联邦探员丹娜·斯科莉（吉莲·安德森 Gillian Anderson 饰）调任某教会医院担任医师，福克斯·穆德（大卫·杜楚尼 David Duchovny 饰）则过着隐居的生活，继续着对超自然现象的关注。某天，FBI探员前来请求他们的帮助。原来一段时间内，维吉尼亚州接连有数名女子神秘失踪，其中甚至包括一名联邦探员。由于神父约瑟夫（Billy Connolly 饰）声称看到了犯罪画面，因此FBI希望对超自然案件有着丰富经验的穆德和斯科莉协助调查。然而随着调查的深入，穆德和斯科莉却发现案件的黑暗远远超出他们的想象。这对合作多年的搭档面临着巨大的考验……
　　本片为同名美剧的第二部剧场版。