特工队拼死收集的证据一夜之间被盗走，抓到的罪犯也因证据不足而无罪释放，成员们一切努力付诸东流。 在此关键时刻，大本营内部再受重创，美怡死于非命。 组织内部有鬼，让队员们开始互相猜忌，一时间人心惶惶、军心涣散。 组织核心成员不得不再次出动，最终寻回黄金夜壶。
明正德年间，禁卫百户耿烈因钦差被杀贬为捕头。此时宁昌府发生连串命案，波及宁王寿宴，耿烈奉命追查。为宁王献画富商被毒杀，刺杀钦差的女杀手再次出现，这一切让耿烈意识到宁昌府酝酿的风暴，将会改变大明的朝局。
香港闹市街头，一辆押款车被前科累累的重犯曹楠（胡军 饰）劫持。重案组高级督察吕明哲（刘德华 饰）率队赶往现场，与曹楠一伙发生激烈火拼。谁知危机关头，一辆突然出现的汽车搅乱战局。曹楠趁机逃走，而那辆车的车主陶成邦（林家栋 饰）被警方请入警局。陶和明哲是老同学，后来作为古惑仔混迹江湖。出事前他刚刚出狱不久。明哲以及成邦的女友燕冰（姚晨 饰）无论如何都不相信他和曹楠无关，而嚣张的曹楠更五次三番戏耍警察。为了抓住这个狡猾凶狠的对手，明哲决定安排内应潜入对方内部，无奈遭遇惨烈挫败。 站在人生的十字路口，陶成邦的选择成为左右战局的关键。而随着风暴愈演愈烈，正邪双方的界限彻底模糊……
罗刚（王羽饰）在亚洲区是个声名显赫的私家侦探，在诚意恳求之下接了一个婚外情的小案子，而第三者名为“唐娜”（坣娜饰），是个歌星。日本黑社会迫使“唐娜”吸毒后，却被罗刚所救，并爱上了她，帮她戒毒。因为罗刚撑握了日本黑社会的贩毒证据，从而日本人抓住“唐娜”，引罗刚自投罗网。“唐娜”为救罗刚而死，最后罗刚消灭了日本黑社会头目
李威七年前偕手下械劫金行,事败被补,复因枪伤警探罪名,被判监七年.此丑事令李次家人备受拖累,其父郁郁而终,妹阿芬误入岐途,弟阿俊则飘然远去,过其海员生涯.七年后,李威出狱,痛改前非,以驾驶的士为业,惜其弟李俊并未原谅其过失.李威偶然碰到旧街坊阿May已成为警队中的女干探.李威虽决心洗手不干,奈何其旧日手下仍然有求于他.此事令李威大为烦恼.李威后因分赃之事,跟昔日手下载伟有猛烈冲突.七年前被李威枪伤之警探泰国基亦一直怀恨在心,亟欲报一箭之仇.与此同时,李威与女探员阿May感情日增.阿May终于发现李威是已经改邪归正之悍匪.二人发生争执.阿May对李威一往情深,并坚信李威不会重蹈覆辙.李威后来遭泰国基和载伟设计陷害,其弟李俊任职之船公司被众匪打劫,李俊亦惨遭杀害.李威在阿May及众警探监视和保护之下,幸免于难,而恶人终有恶报,泰国基和载伟都死于特警乱枪之下
影片讲述了一场震惊全国的特大运钞车抢劫案发生后，嫌疑人小宝在无现场犯罪证明情况下金蝉脱壳，然而犯罪的种子已然在心中生根发芽，伴随着时间野蛮生长，终将在警方的明察秋毫中爆裂迸发……
