1897年，大韩帝国时代动荡混沌，时有不同罪案发生，别巡检调查队四出调查，找寻破案的线索。 别巡检第2季的时代背景为1897年大韩帝国的国号宣布之后，比第1季还要迟些。高宗自俄罗斯回国后自称为皇帝，由此朝鲜便变为帝国，以阐明国家的自主性和独立性。并且施行了财政、教育、军事等几乎全方位的光武改革，令朝鲜向现代化迈进了一大步。因此这个时期应该是比第1季更为激动人心的时期，然而大韩帝国所追求的新价值，让国民看到的却是比任何时候都强大的同一与自主的混乱。
该剧改编自同名瑞典电视剧《Heder》。 讲述三位女律师面对过去的巨大丑闻而展开的追逐故事。
講述了調查1%失蹤案件的專案組員警和惡性犯罪嫌疑人之間對決的故事。FBI出身的天才精英刑警吉秀賢(金康宇 飾)和純度100%的本土老派勢力刑警吳大榮(朴熙順 飾)的搭檔將怎樣在一定期限內找出失蹤者並與前所未聞的惡性犯罪者抗衡的故事，以‘失蹤’為主題，不僅將描繪尋找失蹤者的過程，還將會是一段尋找社會丟失的正義、價值的旅程，是一部全新題材的刑偵劇。
李成桂（千浩振饰）为了正式的投身政治启程去往开京，李芳远（刘亚仁饰）也跟随着父亲去了开京。来到开京的李芳远看到了置百姓死活于不顾只为自己填饱肚子的权文势族，无法抑制住自己内心的愤怒。原本就对于李成桂的政界出仕很警惕的李仁谦（崔钟元饰）将李成桂邀请到自己家里并举办了宴会，在宴会上李仁谦给他看了以他背叛了曾经像兄弟一样的赵小生（安吉强饰）为题材的街头剧。在宴会结束后李成桂为了让李仁谦保守自己背叛赵末生的秘密，向李仁谦低下了头，李芳远目击到了这一幕
