《五星红旗迎风飘扬2》承接“两弹一星”的故事，从1970年4月我国第一颗人造卫星上天写起，着力塑造毛泽东、周恩来、邓小平等老一辈革命家运筹帷幄，在复杂多变和严峻的国际环境中，审时度势，从容应对，始终立于主动地位。为了维护祖国的主权、领土完整和民族尊严，他们进行的坚定而有理有力的斗争，在严重困难面前，他们带领全国人民，迎难而上，以不屈的姿态和昂扬的精神面貌去战胜和克服困难，终于走出了一条中国特色的社会主义道路。
仙帝陆泽渡劫时，红颜姜若萱舍身相救，残魂随玉玲珑流落蓝星。陆泽突破仙帝后下界寻她，找到失忆的柳青青。二人卷入柳刘两家武学世家纷争，历经生死考验后玉玲珑觉醒，柳青青恢复记忆，二人联手平定风波，长相思守。
中国台湾女生周小鱼携父骨灰赴厦寻母，因与母隔阂选择签约MCN公司独立谋生。她与摄影师张子为组成“垃圾联盟”，以美食探店直播创业。不料父亲遗留的巨额债务引讨债人豪捷跨海追缉，直播镜头下的追逃闹剧意外揭开父母分离真相——父亲因专利技术遭构陷致死。周小鱼联合团队以直播为武器，智斗豪捷设下的假货陷阱，最终完成复仇。横跨两岸二十余年的时光之钟，于沙茶面的烟火气中敲响笑泪交织的团圆终章。
星晨未来。
兴安岭深山，挖参人刘老栓与好友进山寻参，却遭遇离奇变故：一人横死，一人失踪。走投无路之际，他请来了被村里驱逐多年的老猎人马三爷。谁料马三爷刚入村，怪事便接连不断：引魂鸡暴毙，丧宴上众人陷入幻觉，深夜有人在废宅埋纸人，古井中更涌出让人命丧的毒鱼，百年村落人心惶惶。与此同时，一个声称知晓十年前往事真相的神秘人悄然现身，将陈年旧案与眼前怪事隐隐相连。马三爷携徐英子步步深入，层层抽丝剥茧，一个潜伏已久的惊天阴谋逐渐浮出水面......
关潮为了能回到过去，寻找着能启动时间枪的能源“灼石”，却意外掉入了记忆管理局。为了能重新回到现实，关潮和方糖、百重等记忆管理员一起逐层回收记忆层中的BUG人。随着一场场战斗相继落幕，关潮要面对的是……
玉茗格格（李小冉 饰）深受父皇乾隆（许文广 饰）喜爱，她在宫里天不怕地不怕，只怕一种东西，那就是毛毛虫。玉茗无事在民间闲逛，结识了几个年龄相仿的伙伴。随着年龄增长，格格喜欢上了上官锦弘（卲峰 饰），但她做梦都想不到上官竟是她同父异母的哥哥，这是当年父皇一夜风流欠下的孽债，两人自不知情，兀自真诚相爱。乾隆得知宝贝女儿爱上了上官锦弘，龙颜大惊，设计将玉茗许配给和珅之子殷德（苗海忠 饰）为妻，遂向玉茗道出实情，玉茗闻言芳心俱焚，拉着上官跳崖殉情，不料殉情未果，玉茗成了疯子，上官则失去了记忆。不久，宫里传来流言蜚语，和珅之子殷德竟是乾隆的私生子......
伯爵府庶女顾铮因一场“下药”风波被家人陷害致死，重生后发现清冷国师沈暥竟主动替她出头，还亲自请旨赐婚。二人表面是合作夫妻，实则各怀心思——沈暥借联姻周旋于太子与端王之间，追查母亲被害真相及皇子身世；顾铮则褪去前世怯懦，霸气破局、聪慧自保，改造书馆助力寒门，彻底摆脱庶女困境。权谋交锋中，二人放下戒备、互生情意，伴随一切真相渐渐浮出水面，二人将走向怎样的结局？
