冒险家赤间健一在德国探险时发现了一个大洞穴，洞穴通往一座建在附近的城堡。在城堡里面，赤间救下了被一群神秘人袭击的本乡秀树博士。本乡博士是未来科学研究所的领导人，而袭击他的人隶属毁灭了数个文明的暗黑科学帝国Death Dark。 与此同时，Death Dark建造的机械岛·暗黑巨大城死亡乌托邦从海底出现，开始征服世界。本乡博士为了粉碎Death Dark的阴谋，在此前已准备组成一支战队。经过电脑的挑选，赤间健一、黑田官平、青山三郎、黄岛太、桃园美树成为大战队的队员。正与邪的较量一触即发……
在23世纪，一艘名为萨尔德斯号的宇宙探测采矿船正在执行一项艰巨的任务，这个任务预计需要持续整整20年。船上共有14名经过训练的船员，以及一只可爱的名叫莉莉的猫咪。在漫长的航程中，一场意想不到的危机降临了。从冬眠中苏醒的某些船员发现，一颗陨石撞击船体，随之而来的是一种不明病毒的入侵。这种病毒神秘地寄生在人类身上，具有惊人的变异能力，可使感染者以任意的形态转变，甚至变成人们想象中神话传说中的各种怪物。 情势的急转直下让船员们陷入了混乱和恐惧之中。无法辨别谁已被寄生成了怪物，他们互相猜疑、争斗不休。每当黑夜降临，紧张的氛围渗透在船舱的每个角落，船员们都战战兢兢，小心翼翼。在这个紧迫的局势中，不幸的死亡事件接连发生。每一次丧命都让剩下的人更加警惕，同时也深埋了更多的猜疑和恐惧。他们开始收紧安全措施，限制彼此的交流，并加强防护措施，以尽量减少病毒的传播。
故事发生在名为“眉难”的高级中学里，由布院烟（梅原裕一郎 配音）和鬼怒川热史（西山宏太郎 配音）是社团“地球防卫部”中的一员，某日，在澡堂里，两人意外邂逅了名为翁巴特（麦人 配音）的神秘生物，翁巴特提出了一个离奇的请求，那就是希望他们能够“守护地球”。 次日，翁巴特再度现身于校园之中，误打误撞之下，与其说是天真烂漫不如说根本就是一个笨蛋的箱根有基（山本和臣 配音）、爱财如命的鸣子硫黄（白井悠介 配音）、校园超人气男神藏王立（增田俊树 配音），以及由布院烟和鬼怒川热史五个人，成为了为保护地球而战的“变身少年”。
