住在以第七迷宫为中心的城镇，支乡的年轻人阿里巴巴，通过做着车夫的打工逐渐实现着自己攻略迷宫，成为大富翁的梦想。这样的一天，他与为寻找『魔神的金属器』而旅行着的迷之少年，阿拉丁相遇了。阿里巴巴在目睹了潜藏于他所持有的笛中的『乌戈君』的力量后，向阿拉丁提出了共同进行迷宫攻略的邀请。 魔笛MAGI第二季全集动画预定播放内容为原作的大圣母篇。
故事舞台设定在被人遗忘的街道“旧都·东京”，而各种事件也大多发生在这个旧都·东京之中。故事的男主角是一个年仅11岁的美型少年日向真行（日向マユキ）。他与管家晴岚、女仆初实一起，凭借着寄宿在日向身上的不可思议的能力“神智”开始向旧都·东京发生的《梦幻事件》发起了挑战。
勇者刑是最严重的刑罚。 犯了大罪被判处勇者刑的人，将受到勇者的惩罚。 所谓惩罚，就是在突然产生魔王军的魔王现象的最前线，即使被魔物杀害，也必须复活并继续战斗。 数百年战斗不休的狂战士、史上最恶劣的小偷、骗子政治犯、自称国王的恐怖分子、成功率为零的刺客等，全部是性格破绽者组成的惩罚勇者部队。 他们的领袖、因“杀死女神”的罪名自己也被判处勇者刑的原圣骑士团长扎伊洛·福尔巴茨，在战争中遇到了至今为止一直被隐藏着存在的“剑之女神”特奥丽塔。 “助我一臂之力，接下来我们要打倒魔王” “就是这种意思。 胜利的时候请抚摸我的头哦” 当两人签订契约的时候，一个改变被绝望笼罩着的世界的惨烈英雄的故事拉开
故事中的世界是以中世纪欧洲为基本架构，除了人类以外还有龙、精灵以及哥布林的存在，是典型的托尔金系统中的奇幻世界。神与魔不断地纷争，神为了保卫世界而战；魔为了争取长杖毁灭世界而战。赤眼魔王和赤龙神为了各自的目的而战。赤龙神将赤眼魔王击败，并将它分为七部份。为了防范魔族的行动，他化为四个分身固守着四方。 一千年前，魔王的一部份觉醒了。它率领着魔族们向赤龙神的一个分身——水龙王挑战。魔王五个手下中的四个设下了结界，由它和魔龙王一起直接跟水龙王决斗。后来，魔王的计划宣告失败，魔龙王被封印。魔族的行动渐趋寂静…… 一千年后，自称“天才美少女魔导士”莉娜·因巴斯诞生了。故事也从她在森林里遭遇盗贼，得到流浪佣兵高里·卡布列夫的相助开始。从此他自称为莉娜的监护人成为共同旅行的伙伴。而两人的命运又和魔王有着不可分割的关联.....
很久很久以前，在原始的混沌之海中，从无边的黑暗中诞生了唯一一个纯真的意志。这个意志所产生的力量，让原本一片虛无的混沌之海发生变化。她如造物主般分出了无数世界，这些世界是由无数石柱一般长杖支撑在混沌之海上。她，是这世间万物的母亲。因此，有了神，有了魔，也有了人类。神与魔不断地纷争，神为了保卫世界而战，魔为了争取长杖毀灭世界而战……by:m.yakubd.cc
