1897年，大韩帝国时代动荡混沌，时有不同罪案发生，别巡检调查队四出调查，找寻破案的线索。 别巡检第2季的时代背景为1897年大韩帝国的国号宣布之后，比第1季还要迟些。高宗自俄罗斯回国后自称为皇帝，由此朝鲜便变为帝国，以阐明国家的自主性和独立性。并且施行了财政、教育、军事等几乎全方位的光武改革，令朝鲜向现代化迈进了一大步。因此这个时期应该是比第1季更为激动人心的时期，然而大韩帝国所追求的新价值，让国民看到的却是比任何时候都强大的同一与自主的混乱。
因被人诬陷谋反而没落的官宦家之女，在女扮男装卖书糊口的过程中，与拥有帅气外貌的神秘书生相识后展开的故事。最后她发现原来这位神秘的书生是吸血鬼，而且在朝鲜宫中还有邪恶的吸血鬼存在。
经历了一场事故后发生180度转变的男人韩胜柱（智铉寓 饰）“外表看起来好端端的，只要稍微一刺激他就会变成个实实在在的疯子”。蜜汁执着于荷尔蒙，为做研究对韩胜柱穷追猛打的女人朱仁雅（李诗英 饰）“荷尔蒙，这一切都是因为荷尔蒙！” 因荷尔蒙而开始的荷尔蒙罗曼史。
赵强子（金喜善 饰）曾经是人见人怕称霸一方的不良少女，如今，早已经“金盆洗手”的她藏起了所有锋芒，成为了一名母亲。让赵强子没有想到的是，自己的女儿吴雅兰（金裕贞 饰）竟然成为了校园暴力的受害者，更让赵强子难过的是，当她鼓动女儿为自己讨回公道时，女儿竟然选择了沉默。从来不按常理出牌的赵强子想出了一计，就这样，她入驻了女儿的班级，成为了女儿的同班同学。 充满了冲突的校园生活就此拉开序幕，想要解决问题的赵强子自己却成为了最大的问题。在这里，赵强子需要面对的不仅仅是来自学生们的非议和压力，更在无意之中发现了学校财团那不可告人的秘密。
