第23季的故事是从右京接受上级的指令着手编撰《警视厅150年史》开始的。 明治7年，警视厅由原萨摩藩士·川路利良创立。他与内务卿·大久保利通一起创建了警察机构，就任第一代大警视（现在的警视总监）。但是，后来大久保遭遇了暗杀的悲剧——。像那样的警察黎明期发生的事件一样，发生了大人物政治家被杀的事件！阻挡在开始调查的特命系面前的，是在现代日本扩大的“贫富差距”的现实，以及在政界蔓延的权力者们的野心和阴谋——！？ 150年前和现在——随着社会的变化，“正义”是否也发生了变化……！？
在旅行的列车上，美雪（铃木杏 饰）再次邂逅了金田一（松本润 饰），并追随于他。同伴用手中的DV记录着发生的一切。某夜，一个木偶团长不幸被害。案发后，警探发现他原本在车厢里的尸体不翼而飞，于是引起了一阵骚乱。探长决定在一家酒店暂时住下，找寻犯罪嫌疑人，金田一等人也一同前往。后来，根据案情，嫌疑人被锁定在木偶团体成员之中，探长想通过体重以缩小搜查范围。但是，一个女成员的意外死亡，却让金田一发现了隐藏的秘密，并由此揭开了一桩尘封多年的旧案真相…… 本片根据天树征丸的漫画改编，除上述特别版魔术列车杀人事件外，还包括以下6个事件，分别为幽灵客船杀人事件、法兰西银币杀人事件、黑死蝶杀人事件、速水玲香诱拐杀人事件、魔术的森杀人事件和露西亚人形杀人事件。
该衍生剧讲述了社交能力强、恋爱经验丰富却对人类恋爱感到厌倦的青年功介，意外坠入两段“非典型恋情”的成长故事。在决定只爱动物后，功介对住院的狗狗“优卡”一见钟情，并暗恋着狗咖啡店“Lovely Tails Café”的店长宫濑优香。然而，无论是面对优香还是优卡，向来自信满满的功介都发现自己毫无胜算，陷入苦恼。故事聚焦于他“败犬”式的情感挣扎与内心成长，是本篇未曾呈现的另一面恋爱插曲。
