1897年，大韩帝国时代动荡混沌，时有不同罪案发生，别巡检调查队四出调查，找寻破案的线索。 别巡检第2季的时代背景为1897年大韩帝国的国号宣布之后，比第1季还要迟些。高宗自俄罗斯回国后自称为皇帝，由此朝鲜便变为帝国，以阐明国家的自主性和独立性。并且施行了财政、教育、军事等几乎全方位的光武改革，令朝鲜向现代化迈进了一大步。因此这个时期应该是比第1季更为激动人心的时期，然而大韩帝国所追求的新价值，让国民看到的却是比任何时候都强大的同一与自主的混乱。
济州岛高级饭店，一场华丽盛大的结婚典礼。新郎申贤宇（韩相镇饰）正幸福的等待着新娘朱雅兰（李素妍饰）的到来，然而这将是一场阴谋与复仇的开始。从小父母双亡的雅兰一直过着不幸的生活。当她意外得知父母是被申氏家族所害的时候，决定不顾一切地展开报复。 在缜密的复仇计划下，雅兰嫁给了自己仇家的儿子贤宇，随即开始了她不择手段的报复。一次偶然的机会，贤宇得知了雅兰的秘密。被仇恨冲昏头脑的雅兰居然设计了一场车祸，欲将贤宇置于死地。然而贤宇死里逃生，却成为了植物人。恢复意识的贤宇誓要报复这个狠毒的女人，保护自己的家人。经过全身整形，此时的贤宇（裴秀彬饰）以英俊潇洒的海归商人的身份形象再次出现。一场因复仇而起又陷入另一个复仇漩涡的较量旋即开战。
短片集由四位导演联合执导。 李京美([没有秘密])执导的短片[爱情零剧]讲述两名女网球运动员的一场极具激情的比赛； 任弼星([布拉芙夫人])执导的短片[久不腐败]讲述一个魅力十足的女人，能够让任何男人为她放弃一生； 全高云([小公女])执导的短片[亲吻是罪]围绕两个发誓要甜蜜复仇的女孩展开； 金宗宽([桌子])执导[走在夜里]的短片围绕一对在梦中再次相遇的恋人展开。
