《陌生人6》的故事发生在未来的韩、中、日三国经济共同区域——大连。三国情报当局获知以大连为震中，5年内极有可能发生一场毁灭性的大地震，威胁到三国乃至整个亚洲的存亡。而唯一能阻止这场大地震的方法是在大连机场地下设置特殊装置，将能源排放到地壳之外。三国为此决定秘密进行工程。但有一股黑暗势力企图暗杀工程相关负责人、阻止工程、泄露秘密。于是，三国情报当局各派出2名要员，与这股黑暗势力展开斗争。
被“奇特又美丽的变态植物”深深吸引、几乎到了疯狂程度的主人公副岛，将在每一集中与一种植物面对面，并造访城市角落里那些充满偏爱气质的特色小店。
22岁的美女十川一华（广濑爱丽丝饰）得到亡父的巨额遗产，因此亲戚们想将她伪装成事故杀害，夺取金钱。为了保护她，和她共住的家政妇桥田政子（水野美纪饰）雇用了名侦探千曲川光（泷藤贤一饰）。他能够察觉细微的“违和感”，抢先犯人一步，解开并阻止犯人“还没有设置的诡计”。千曲川能防患于未然，保护一华平安吗？
故事舞台设定在迎来创立122周年的私立百花王学园，这是一所财政界大人物子女就读，有传统有地位的名门学校，决定学生阶级高低的就是赌博技巧，获胜者得到地位与名誉，失败者会被剥夺财产和尊严，故事从神秘转校生蛇喰梦子（滨边美波 饰）的出现开始。梦子平时优雅文静，但一旦开始赌博的话，就会成为“狂赌魔女”。她用超乎常人的洞察力、记忆力和交涉力玩弄对手，即使冒极大风险也要一决胜负，最终把他们推下毁灭的深渊。
