1897年，大韩帝国时代动荡混沌，时有不同罪案发生，别巡检调查队四出调查，找寻破案的线索。 别巡检第2季的时代背景为1897年大韩帝国的国号宣布之后，比第1季还要迟些。高宗自俄罗斯回国后自称为皇帝，由此朝鲜便变为帝国，以阐明国家的自主性和独立性。并且施行了财政、教育、军事等几乎全方位的光武改革，令朝鲜向现代化迈进了一大步。因此这个时期应该是比第1季更为激动人心的时期，然而大韩帝国所追求的新价值，让国民看到的却是比任何时候都强大的同一与自主的混乱。
一位普通，无能的教师突然有一天从天上掉了一个10亿元的馅饼，就是为黑社会老大的独生女儿当课外辅导老师，前提是如果孩子出问题，他也没有命。 我们每个人经历的第一个大学就是学校，学校是世界的缩小版，也是为各自的目的战斗的地方。在这里我们遇到了不同的人，相互学习，相互竞争，相互讨厌，相互喜欢。 有时快乐，有时会想忘却一切，但共同点就是我们在从中成长起来的事实。和成年人的社会一样，在那里也有看不见的阶级，规则，以及战争，但是当我们瞬间抛弃这一切的时候，我们就变成了朋友。 随着时间的流逝，我们也许会忘记教科书上的内容，但是书上没有的故事却留在了我们的记忆中。
该剧将以十几岁青少年的视角讲述韩剧少见的大麻、毒 品、犯罪的故事。描写发现大麻田的18岁少女多贞和她的朋友们寻找遗失的平凡日常的故事。
该剧讲述了关于韩国特有的职务暗行御史的故事，他虽然是百姓的嘴巴，是王的耳朵，但是却不显露自己，他们的职务是相当于帮现代人实现正义的人物，通过描绘朝鲜时代真正的暗行御史来向我们展现对于我们来说真正需要的英雄的故事。
